La Fédération s’engage pour une promotion par des moyens publics et tiers de la recherche en médecine complémentaire au niveau des universités et des hautes écoles spécialisées.
L’objectif est d’obtenir un programme national de recherche (PNR) en médecine complémentaire par le Fonds national suisse. Le Conseil fédéral qui dicte les thèmes pour les programmes nationaux de recherche a posé, avec l’article constitutionnel 118a pour les médecines complémentaires, les bases légales d’un mandat de programme national de recherche en médecine complémentaire.